Frøslevlejrens Museum belyser hovedsageligt den tidsperiode, hvor lejren fungerede som fangelejr for det tyske sikkerhedspolitis fanger i Danmark 1944-45.

Lejrens historie ophørte dog ikke ved Danmarks befrielse 5. maj 1945, men fortsatte som interneringslejr og senere straffelejr for landssvigere under navnet Fårhuslejren.