Flåden moderniseres i 1600-tallet

Det blev admiralerne Cort Adeler og Niels Juel, som gennemførte en målbevidst modernisering af orlogsflåden i slutningen af 1600-tallet. I Danmark var man klar over, at en stærk flåde var en forudsætning for landets eksistens, og moderniseringer fandt sted inden for næsten alle områder af flådens virke.

Der indførtes et system, hvor søfolk fik et beløb for at stå til rådighed samt ret til at slå sig ned som erhvervsdrivende i købstæderne. Det gav mulighed for hurtig bemanding af skibene.

I København var der efterhånden ikke plads til de mange skibe i den indre havn mellem Gammelholm og Tøjhuset, så man begyndte at indrette flådens leje på Christianshavn, og samtidig begyndte opfyldningen af Nyholm og de områder, som under ét kaldes Holmen. Forholdene for den faste stab på Holmen blev forbedret, idet Nyboder blev repareret og udvidet.