Nationalmuseets Naturvidenskabelige Undersøgelser (NNU) har siden sin grundlæggelse i 1940 udført selvstændige undersøgelser, samt deltaget i lokalmuseernes arkæologiske udgravninger og forskningsprojekter.

NNU huser en række fagområder og specialister indenfor det miljøarkæologiske forskningsområde og bidrager med viden om fortidige natur- og kulturforhold og tids- og stedfæstelse af genstande og begivenheder gennem forskning og metodeudvikling.

NNU's referencesamlinger er blandt Europas største og dækker Nordeuropa, Grønland og den Nære Orient.

NNU forsker og rådgiver indenfor Dendrokronologi, Pollenanalyse, Vedbestemmelse og Makrofossilanalyse.